Préchauffer le four à 190°C.
Dans une grande casserole d'eau bouillante salée, cuire les coquilles de pâtes géantes selon les instructions sur l'emballage jusqu'à ce qu'elles soient al dente. Égoutter les coquilles et les rincer à l'eau froide pour arrêter la cuisson. Réserver pour les faire sécher légèrement.
Dans un grand bol, mélanger la purée de potiron, le fromage ricotta, ½ tasse de mozzarella râpée, le parmesan râpé, la poudre d'ail, la sauge séchée, la muscade moulue, le sel, le poivre et l'œuf. Bien mélanger jusqu'à obtenir une consistance crémeuse et homogène.
Verser environ 240 ml de sauce marinara au fond d'un plat de cuisson de 23x33 cm, en l'étalant uniformément.
Prendre chaque coquille cuite et la remplir généreusement avec le mélange de potiron et ricotta. Placer les coquilles farcies dans le plat de cuisson, ouverture vers le haut.
Verser la sauce marinara restante sur les coquilles farcies, en veillant à bien les enrober. Saupoudrer ensuite la ½ tasse restante de mozzarella râpée sur le dessus.
Arroser légèrement d'huile d'olive sur le dessus.
Couvrir le plat de papier d'aluminium et cuire pendant 25 minutes. Retirer ensuite délicatement le papier d'aluminium et cuire pendant 10 minutes supplémentaires, ou jusqu'à ce que le fromage soit fondu, bouillonnant et doré.
Une fois la cuisson terminée, retirer le plat du four et laisser reposer environ 5 minutes.
Garnir les coquilles farcies de persil frais ou de feuilles de sauge si désiré, et servir chaud.